Les projets

Projet PREVBIO « Effets synergistiques des facteurs de risque de cancer sur l’épigénome du tissue mammaire » Synergistic effects of cancer risk factors on the epigenome of the mammary tissue

Le but de ce projet est d’étudier l’impact de l’accumulation des facteurs de risque du cancer du sein (masse corporelle accrue, augmentation de la densité/rigidité du tissu et le stress oxydatif conduisant au vieillissement accéléré des cellules) sur l’épigénome en utilisant des organes- et tissus-sur-puce et une banque de tissus humains représentant différents niveaux de risque de cancer du sein. Les objectifs spécifiques sont de définir les signatures épigénétiques et transcriptionnelles des cellules épithéliales lorsque des facteurs de risque sont combinés (objectif 1) et identifier des mécanismes qui sous-tendent une influence réciproque des changements épigénétiques et de la réponse aux dommages de l'ADN sous la pression du risque (objectif 2).  Ce projet devrait fournir des biomarqueurs issus d’exosomes pour l'étude clinique du risque et des orientations pour la conception d'interventions visant à réduire le risque de cancer. Il entre dans le cadre de la task force « risk stratification and reduction-RisRED) du programme collaboratif REGEN.

Synopsis in English: The aim of this project is to study the impact of the accumulation of breast cancer risk factors (increased body mass, increased tissue density/stiffness and oxidative stress leading to accelerated cell aging) on the epigenome using organs- and tissues-on-chip and a human tissue bank representing different levels of breast cancer risk. Specific objectives are to define epigenetic and transcriptional signatures of epithelial cells when risk factors are combined (objective 1) and to identify mechanisms underlying a reciprocal influence of epigenetic changes and DNA damage response under risk pressure (objective 2).  This project should provide exosome-derived biomarkers for the clinical study of risk and guidance for the design of interventions to reduce cancer risk. It is part of the "risk stratification and reduction-RisRED" task force of the collaborative program REGEN.

Financement/Awards : Institut National du Cancer (France) (INCa ; programme PREVBIO), 2022-2024

Participants :  Sophie Lelièvre (Lead/Coordinatrice ; Equipe/Team SCaT ; ICO)  Pierre-Alexandre Vidi (colead ; Equipe/Team InGeNo, ICO) Pierre-François Cartron (colead, Equipe/Team 7, CRCINA, INSERM, ICO) Luciano Vidal and Jean-Yves Hascoët (coleads ; Plateforme de Fabrication Rapide/Rapid Manufacturing Platform, Ecole Centrale de Nantes).  Collaboration with ‘Omics & Data Science’ unit (Pascal Jézéquel, l’ICO).

Publications  

Projet « TSP3- Tumeurs sur puce provenant de patients » Patient-derived tumors-on-chip (PDTOC)

Le but de ce projet est de développer des méthodes de culture de cellules de patients in vitro qui reproduisent l’architecture de leurs tumeurs spécifiques afin de déterminer leur sensibilité aux traitements. La phase I financée du projet inclut (1) l’élaboration des protocoles de mise en culture des cellules de patients permettant de conserver l’hétérogénéité cellulaire ; (2) la production et les tests des plateformes de culture-sur-puce permettant de reproduire de façon contrôlée l’architecture des tumeurs, et (3) la mise en place de processus d’analyse et de reproduction des critères architecturaux de chaque tumeur. Ce projet rentre dans la cadre de la médicine de précision et est une collaboration entre cet axe et celui de la prévention à l’ICO pour développer à terme une plateforme d’ingénierie des cancers (PIC). 

Synopsis in English: The goal of this project is to develop in vitro cell culture methods that reproduce the architecture of specific tumors in order to determine their sensitivity to treatments. The funded Phase I of the project includes (1) the development of protocols for culturing patient cells while maintaining cellular heterogeneity; (2) the production and testing of culture-on-a-chip platforms to reproduce tumor architecture in a controlled manner; and (3) the design of processes to analyze and reproduce the architectural criteria of each tumor. This project falls within the framework of precision medicine and is a collaboration between this axis and that of prevention at the ICO to eventually develop a cancer engineering platform (CIP).

Financement / Awards : Comité Féminin 49, 2022-2024 ; Fondation de L’avenir (award pending), 2022-2023

Participants :  Sophie Lelièvre (Lead/Coordinatrice ; Equipe/Team SCaT; ICO)  Marie Robert (collaborator, Département d’Oncologie Médicale- sénologie et neuro-oncologie ; Unité des thérapeutiques précoces, ICO) Luciano Vidal & Jean Yves Hascouët, (collaborators, Plateforme de Fabrication Rapide/Rapid Manufacturing Platform, Ecole Centrale de Nantes) Collaboration with ‘Omics & Data Science’ and ‘Anatomopathologie’ units (ICO)

Projet « Biomarqueurs pour la stratification du risque » Biomarkers for risk stratification.  Ce projet international et transdisciplinaire en cours de développement a pour but de proposer une approche nouvelle pour la détermination des biomarqueurs du risque de cancer du sein qui sont à la fois des cibles pour détecter le risque accru de ce cancer (prévention primaire) et des cibles pour stopper son évolution (prévention tertiaire).  Ce projet entre dans le cadre des task forces ‘risk stratification and reduction-RisRED’ et ‘Community Capacity Building to Tame Risk- CCaBTaR’ du programme collaboratif REGEN.

Synopsis in English: This international and transdisciplinary project under development aims to propose a novel approach for the identification of biomarkers of breast cancer risk that are both targets to detect the increased risk of breast cancers (primary prevention) and targets to stop the progression of these cancers (tertiary prevention).  This project is part of the task forces 'risk stratification and reduction-RisRED' and 'Community Capacity Building to Tame Risk- CCaBTaR' of the REGEN collaborative program.

Participants (Phase Préliminaire/Preliminary Phase) : Sophie Lelièvre, (Lead ; programme REGEN) Mary Beth Terry (colead ; Columbia University NY, USA) Rabih Talhouk et Rihab Nasr (coleads ; American University of Beyrouth, Lebanon) Pierre-François Cartron (colead ; Equipe/Team 7 CRCINA INSERM, ICO).